Para cumprimento de suas finalidades, a estrutura organizacional da ATI se orienta por processos, atuando de forma articulada e matricial junto aos  NSIs dos órgãos e entidades da Administração Pública Eetadual (APE).

A Diretoria Executiva de Tecnologia da Informação e Comunicação (TIC) e a Coordenadoria Executiva de Logística e Gestão são os órgãos executivos de direção superior.

São atribuições da  Diretoria Executiva de Tecnologia da Informação e Comunicação:

• Dirigir as atividades de prospecção, normatização, suporte à regulação e prestação de serviços técnicos de informática e comunicação realizados pelas unidades da estrutura técnica da ATI;
• Supervisionar e orientar o desenvolvimento de estudos e propostas para o modelo e as políticas de informática do Governo Estadual e para a formulação de arquiteturas, serviços e soluções tecnológicas de TIC;
• Gerir a logística de aquisição, contratação e suprimento de serviços e produtos técnicos de informática e comunicação;
• Analisar e propor a homologação dos Planos Diretores de Informática setoriais;
• Supervisionar o atendimento das demandas e serviços da ATI e os níveis de satisfação dos usuários;
• Supervisionar, acompanhar e avaliar os níveis de desempenho das unidades da estrutura técnica da ATI;
• Dar suporte e assessoramento ao diretor-presidente da ATI em matéria técnica;
• Representar a ATI em associações, fóruns e encontros técnicos.

A Gerência Administrativa e Financeira cumpre as normas dos Sistemas Administrativos e Financeiros Centrais do Estado e tem as seguintes atribuições principais:

• Gerir as atividades administrativas e financeiras no âmbito da ATI, provendo o suporte necessário nesses campos ao funcionamento da Agência;
• Coordenar as atividades de segurança física e patrimonial, manutenção, limpeza e conservação, transportes, comunicação, documentação, biblioteca e outros serviços auxiliares;
• Gerir os bens patrimoniais, registrando-os, controlando-os e propondo e executando suas alienações quando autorizado;
• Promover a articulação da ATI com a SAD junto aos sistemas de compras eletrônicas e centralizadas do Governo do Estado do Pernambuco, relativamente à aquisição de produtos e serviços administrativos; coordenar as atividades de compras de bens e serviços, instrumentalizando os processos de licitação e encaminhando-os à Comissão Permanente de Licitação (CPL);
• Coordenar as atividades de programação, execução, supervisão e controle orçamentário e das receitas e despesas da ATI; elaborar estudos econômico-financeiros, propostas orçamentárias e de execução financeira;
• Acompanhar e controlar os aspectos financeiros dos contratos e convênios.

O funcionamento da estrutura da ATI será orientado por processos de trabalho, devendo para isto ser observado o princípio de articulação entre as suas diversas unidades, segundo os requerimentos técnicos dos processos, superando-se com isto as relações burocráticas baseadas meramente nas cadeias de comando.

O relacionamento das unidades da estrutura interna da ATI com os NSIs é feita, fundamentalmente, através da Gerência de Relacionamento (GRG), responsávelpela coordenação do atendimento às demandas de TI, originadas pelos órgãos e entidades da APE. Os NSIs representam, assim,  o canal privilegiado para o relacionamento entre a ATI e a APE.

A Gerência de Normatização e Desenvolvimento é responsável pelas atividades de planejamento, coordenação, implantação e manutenção do Sistema Integrado de Gestão GRP, pela prospecção, disseminação e suporte tecnológico de TI às estruturas técnicas e usuárias da APE e pelo desenvolvimento e gestão de conhecimento relacionado com o modelo, organização e gestão de TI.

A Gerência de Infra-estrutura e Serviços Compartilhados coordena e supervisiona as atividades do Data Center, (produção de serviços, manutenção de infra-estrutura, gestão de demandas e capacidades de processamento e armazenamento), as atividades de configuração, operação e manutenção da rede multidigital, além da coordenação dos processos de segurança, certificação digital e chaves públicas.

Organograma da ATI